Поразмышлять хочется на эту тему, но не судите строго, так как я не пишу подобное программное обеспечение, да и не являюсь его активным пользователем. Это юридический отдел, экономисты и бухгалтеры все на этом завязаны.
Но что хочу сказать? Самописные программы хороши тем, что предприятие само определяет фронт работы, стратегию, обновления, удобства использования. Если же программы лицензированные, да еще и такого уровня, как 1С и подобные, то там уже давно включено все, что мы самостоятельно только придумаем через год. Они постоянно обновляются и поэтому такие программы наиболее удобны для работы - тех же расчетов, учета и так далее.
Компания, которая работает именно над выпуском программ и правильной их работоспособностью, думаю, лучше соображает в том, что нужно предприятию. Тем более, всегда можно доработать программу под собственное предприятие, но сделать это уже на базе сильного и разумного софта!
Да, для небольших предприятий много чего ненужного, а потому они работают вообще без программ, некоторые даже без ПК, максимум в журналах и книгах расчетных. Но крупным предприятиям современный учет просто необходим.

- программы 1с